MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 44408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	AATG	2	8	59	66	50 %	25 %	25 %	0 %	58578665
2	NC_006832	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
3	NC_006832	GATT	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
4	NC_006832	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
5	NC_006832	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
6	NC_006832	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
7	NC_006832	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
8	NC_006832	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
9	NC_006832	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
10	NC_006832	ACTA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	58578665
11	NC_006832	CA	3	6	708	713	50 %	0 %	0 %	50 %	58578665
12	NC_006832	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
13	NC_006832	TTAG	2	8	758	765	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
14	NC_006832	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
15	NC_006832	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578665
16	NC_006832	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
17	NC_006832	T	6	6	859	864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006832	TAT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006832	ATTT	2	8	937	944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006832	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
21	NC_006832	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578666
22	NC_006832	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
23	NC_006832	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578666
24	NC_006832	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	58578666
25	NC_006832	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
26	NC_006832	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578666
27	NC_006832	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
28	NC_006832	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578666
29	NC_006832	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578666
30	NC_006832	T	6	6	1251	1256	0 %	100 %	0 %	0 %	58578666
31	NC_006832	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578666
32	NC_006832	TATT	2	8	1297	1304	25 %	75 %	0 %	0 %	58578666
33	NC_006832	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
34	NC_006832	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	58578666
35	NC_006832	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578666
36	NC_006832	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
37	NC_006832	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
38	NC_006832	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58578666
39	NC_006832	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	58578667
40	NC_006832	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	58578667
41	NC_006832	AT	3	6	1638	1643	50 %	50 %	0 %	0 %	58578667
42	NC_006832	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
43	NC_006832	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578667
44	NC_006832	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58578667
45	NC_006832	TTTA	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	58578667
46	NC_006832	TTC	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578667
47	NC_006832	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
48	NC_006832	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
49	NC_006832	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
50	NC_006832	ACAG	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	58578667
51	NC_006832	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578667
52	NC_006832	ATT	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006832	TG	3	6	2096	2101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006832	T	6	6	2124	2129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006832	TAT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006832	A	7	7	2166	2172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006832	TAA	2	6	2186	2191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006832	TA	3	6	2210	2215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006832	CAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578668
60	NC_006832	TCT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578668
61	NC_006832	AT	3	6	2430	2435	50 %	50 %	0 %	0 %	58578668
62	NC_006832	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
63	NC_006832	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578668
64	NC_006832	GTA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
65	NC_006832	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	58578668
66	NC_006832	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	58578668
67	NC_006832	T	7	7	2811	2817	0 %	100 %	0 %	0 %	58578668
68	NC_006832	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
69	NC_006832	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578668
70	NC_006832	AGT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
71	NC_006832	CTA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578669
72	NC_006832	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
73	NC_006832	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
74	NC_006832	T	8	8	3258	3265	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
75	NC_006832	CTT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
76	NC_006832	AGTA	2	8	3299	3306	50 %	25 %	25 %	0 %	58578669
77	NC_006832	TAT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
78	NC_006832	TA	3	6	3417	3422	50 %	50 %	0 %	0 %	58578669
79	NC_006832	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
80	NC_006832	TAT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
81	NC_006832	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
82	NC_006832	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
83	NC_006832	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578669
84	NC_006832	CTTTAT	2	12	3756	3767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578669
85	NC_006832	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
86	NC_006832	TGT	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578669
87	NC_006832	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
88	NC_006832	GCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578669
89	NC_006832	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
90	NC_006832	T	6	6	4056	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
91	NC_006832	GGTA	2	8	4070	4077	25 %	25 %	50 %	0 %	58578669
92	NC_006832	T	7	7	4112	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
93	NC_006832	CCT	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006832	TAT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006832	GTT	2	6	4194	4199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006832	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006832	GTAT	2	8	4299	4306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006832	TG	3	6	4328	4333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006832	TCT	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006832	TAA	2	6	4429	4434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006832	TTAC	2	8	4460	4467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006832	TTA	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006832	A	6	6	4554	4559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006832	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
105	NC_006832	T	7	7	4613	4619	0 %	100 %	0 %	0 %	58578670
106	NC_006832	A	8	8	4655	4662	100 %	0 %	0 %	0 %	58578670
107	NC_006832	A	7	7	4673	4679	100 %	0 %	0 %	0 %	58578670
108	NC_006832	ATTA	2	8	4850	4857	50 %	50 %	0 %	0 %	58578670
109	NC_006832	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
110	NC_006832	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
111	NC_006832	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
112	NC_006832	TCC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578670
113	NC_006832	ATTT	2	8	5017	5024	25 %	75 %	0 %	0 %	58578670
114	NC_006832	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
115	NC_006832	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
116	NC_006832	TAG	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
117	NC_006832	GAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
118	NC_006832	ATA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
119	NC_006832	AGA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578670
120	NC_006832	GGT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
121	NC_006832	GTG	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
122	NC_006832	GAT	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
123	NC_006832	TA	4	8	5390	5397	50 %	50 %	0 %	0 %	58578670
124	NC_006832	GATT	2	8	5429	5436	25 %	50 %	25 %	0 %	58578670
125	NC_006832	ATG	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
126	NC_006832	TTC	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
127	NC_006832	ACTAA	2	10	5562	5571	60 %	20 %	0 %	20 %	58578671
128	NC_006832	T	8	8	5587	5594	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
129	NC_006832	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
130	NC_006832	TAG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
131	NC_006832	CTCA	2	8	5753	5760	25 %	25 %	0 %	50 %	58578671
132	NC_006832	TAG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
133	NC_006832	TAT	3	9	5855	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
134	NC_006832	ACA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578671
135	NC_006832	A	6	6	5908	5913	100 %	0 %	0 %	0 %	58578671
136	NC_006832	T	6	6	5922	5927	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
137	NC_006832	TTA	2	6	5934	5939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
138	NC_006832	T	6	6	5959	5964	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
139	NC_006832	TAATT	2	10	6029	6038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006832	TGT	3	9	6065	6073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006832	TAAAA	2	10	6126	6135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006832	AT	3	6	6147	6152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_006832	CATGAA	2	12	11058	11069	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58578676
281	NC_006832	GTG	2	6	11074	11079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578676
282	NC_006832	TGA	2	6	11087	11092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
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284	NC_006832	AT	3	6	11125	11130	50 %	50 %	0 %	0 %	58578676
285	NC_006832	GTG	2	6	11134	11139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578676
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287	NC_006832	GAA	3	9	11151	11159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
288	NC_006832	ATGTA	2	10	11258	11267	40 %	40 %	20 %	0 %	58578676
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293	NC_006832	CAT	3	9	11385	11393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578676
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297	NC_006832	AAT	2	6	11534	11539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_006832	TAT	2	6	11568	11573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_006832	TAC	3	9	13953	13961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578677
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390	NC_006832	TAT	2	6	14244	14249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578677
391	NC_006832	CAT	2	6	14282	14287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578677
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394	NC_006832	AAT	2	6	14390	14395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578677
395	NC_006832	AATA	2	8	14415	14422	75 %	25 %	0 %	0 %	58578677
396	NC_006832	TAGAAA	2	12	14469	14480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58578677
397	NC_006832	TAA	2	6	14525	14530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_006832	AT	3	6	14536	14541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_006832	TTTA	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_006832	CAT	2	6	14737	14742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578678
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406	NC_006832	TACT	2	8	14889	14896	25 %	50 %	0 %	25 %	58578678
407	NC_006832	CCT	2	6	14912	14917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578678
408	NC_006832	GAT	2	6	14946	14951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578678
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410	NC_006832	GTT	2	6	15035	15040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578678
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412	NC_006832	TTA	3	9	15063	15071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578678
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